The design problem starts with scale. Five residues create 3.2 million possible sequences. At 10 residues, the space reaches 10.24 trillion, making exhaustive laboratory search impractical.
El problema de diseño empieza con la escala. Cinco residuos crean 3,2 millones de secuencias posibles. Con 10 residuos, el espacio llega a 10,24 billones, lo que vuelve impráctica la búsqueda exhaustiva en laboratorio.
Peptides are short amino-acid chains, while IgG is a full antibody. GLP-1 is a peptide hormone that became a major engineering target. Virtual screening ranks candidates before laboratory work begins.
Los péptidos son cadenas cortas de aminoácidos, mientras la IgG es un anticuerpo completo. GLP-1 es una hormona peptídica que se convirtió en una diana importante de ingeniería. El cribado virtual clasifica candidatos antes del trabajo de laboratorio.
AI expands molecular design, but researchers still connect computational models to experimental work.
La IA amplía el diseño molecular, pero los investigadores aún conectan los modelos computacionales con el trabajo experimental.
This is the strongest evidence that peptide design is becoming computational. AMP-Designer produced 18 de novo antimicrobial peptides within 11 days. Laboratory activity connected the model output to measured biology.
Esta es la evidencia más sólida de que el diseño peptídico se vuelve computacional. AMP-Designer produjo 18 péptidos antimicrobianos de novo en 11 días. La actividad de laboratorio conectó el resultado del modelo con biología medida.
Structure prediction becomes more useful as its searchable map expands. AlphaFold moved from about 365,000 structures in 2021 to coverage exceeding 214 million protein sequences by 2024. The comparison requires care because the database changed what it counted.
La predicción estructural se vuelve más útil cuando se amplía su mapa buscable. AlphaFold pasó de unas 365.000 estructuras en 2021 a cubrir más de 214 millones de secuencias proteicas en 2024. La comparación exige cuidado porque la base cambió lo que contaba.
Candidate generation can be compared with an older design system. ProteinMPNN reported 52% native sequence recovery, versus roughly 33% for Rosetta. The improvement supports better computational design, not automatic therapeutic success.
La generación de candidatos puede compararse con un sistema de diseño anterior. ProteinMPNN informó una recuperación del 52 %, frente a aproximadamente 33 % para Rosetta. La mejora apoya un mejor diseño computacional, no un éxito terapéutico automático.
The model did not enlarge the laboratory. It enlarged the search before laboratory work began. About 2,500 training compounds supported virtual screening across libraries containing more than 107 million molecules.
El modelo no amplió el laboratorio. Amplió la búsqueda antes de que comenzara el trabajo experimental. Unos 2.500 compuestos de entrenamiento permitieron cribar bibliotecas con más de 107 millones de moléculas.
This is computational peptide design on a laboratory bench. PeptiVerse checks four developability properties before synthesis. It can remove weak candidates earlier, but physical tests still decide whether the predictions hold.
Así se ve el diseño computacional de péptidos en una mesa de laboratorio. PeptiVerse comprueba cuatro propiedades de desarrollo antes de la síntesis. Puede descartar antes candidatos débiles, pero las pruebas físicas todavía deciden si las predicciones se cumplen.
AI can attack the early search, but the economic mountain is much larger. DiMasi and colleagues estimated $2.558 billion before approval. Including post-approval research lifts the total to $2.870 billion.
La IA puede atacar la búsqueda inicial, pero la montaña económica es mucho mayor. DiMasi y sus colegas estimaron 2,558 mil millones antes de la aprobación. La investigación posterior eleva el total a 2,870 mil millones.
The bottleneck is not only the regulator. In this Japanese cohort, clinical development lasted 48.2 months. Regulatory review lasted 19.1 months, so faster design addresses only one part of the calendar.
El cuello de botella no está solo en el regulador. En esta cohorte japonesa, el desarrollo clínico duró 48,2 meses. La revisión regulatoria duró 19,1 meses, así que un diseño más rápido aborda solo una parte del calendario.
Policy can compress a different part of the pathway. The FDA’s 2025 pilot promises selected reviews in 1 to 2 months, with a 1.5-month midpoint. The earlier comparison was 10 to 12 months, but this remains a prospective target.
La política puede comprimir otra parte del proceso. El piloto de la FDA de 2025 promete ciertas revisiones en 1 a 2 meses, con una media de 1,5 meses. La comparación anterior era de 10 a 12 meses, pero sigue siendo un objetivo prospectivo.
AI enters a field that already has depth. A 2018 review found more than 500 preclinical programs and about 140 in clinical trials. More than 60 peptide drugs had already won approval.
La IA entra en un campo que ya tiene profundidad. Una revisión de 2018 encontró más de 500 programas preclínicos y unos 140 en ensayos clínicos. Más de 60 fármacos peptídicos ya habían sido aprobados.
Peptides occupy a useful middle ground. Their common definition reaches about 50 amino acids, while a full IgG contains around 1,300. That smaller scale makes peptides configurable without carrying the full size of an antibody.
Los péptidos ocupan un punto intermedio útil. Su definición habitual llega a unos 50 aminoácidos, mientras una IgG completa contiene cerca de 1.300. Esa menor escala permite configurarlos sin cargar con el tamaño total de un anticuerpo.
The traditional toolkit leaves a large share of human proteins out of reach. AstraZeneca puts that share at 85%. The estimate explains the appetite for new modalities, but it remains an interested party’s assessment.
Las herramientas tradicionales dejan fuera de alcance una gran parte de las proteínas humanas. AstraZeneca sitúa esa proporción en el 85 %. La estimación explica el interés por nuevas modalidades, pero sigue siendo una valoración de una parte interesada.
Peptide engineering can solve a basic developability problem. Native GLP-1 has a half-life of roughly 1 to 2 minutes. Semaglutide extends that window to about 7 days, turning a fragile signal into a usable medicine.
La ingeniería de péptidos puede resolver un problema básico de desarrollo. El GLP-1 nativo tiene una semivida de aproximadamente 1 a 2 minutos. La semaglutida extiende esa ventana hasta unos 7 días, convirtiendo una señal frágil en un medicamento utilizable.
Faster design does not remove the laboratory bottleneck. Hold assay capacity fixed and generate 10 times more candidates. The share tested falls from 100% to 10%, moving the constraint downstream.
Un diseño más rápido no elimina el cuello de botella del laboratorio. Si la capacidad de ensayo permanece fija y se generan 10 veces más candidatos, la proporción probada cae de 100 % a 10 %. La limitación se desplaza hacia etapas posteriores.
A large technology industry does not rise on every measure. China’s high-tech share stayed near 30% for much of the period. It then fell to 26.3% by 2024, even as the absolute export value remained enormous.
Una gran industria tecnológica no sube en todas las medidas. La proporción de alta tecnología de China se mantuvo cerca del 30 % durante gran parte del periodo. Después cayó hasta 26,3 % en 2024, aunque el valor absoluto de las exportaciones siguió siendo enorme.
Absolute scale tells a different story from export share. China’s high-tech exports rose from $343.6 billion in 2007 to $936.4 billion in 2021. They fell afterward but still reached $856.8 billion in 2024.
La escala absoluta cuenta una historia distinta de la proporción exportadora. Las exportaciones tecnológicas de China subieron de 343,6 mil millones de USD en 2007 a 936,4 mil millones en 2021. Después cayeron, pero aún alcanzaron 856,8 mil millones en 2024.
Technology ecosystems attract outside participation as they deepen. Nonresident patent filings in China rose almost continuously across two decades. The total reached 159,019 in 2021, roughly 6 times the 2000 level.
Los ecosistemas tecnológicos atraen participación externa a medida que se profundizan. Las solicitudes de patentes de no residentes en China aumentaron durante casi dos décadas. El total llegó a 159.019 en 2021, cerca de 6 veces el nivel de 2000.
Software industries scale after digital access becomes ordinary. In Brazil, internet use rose from 2.9% of the population in 2000 to 84.5% in 2024. Biology lacks an equivalent shortcut because molecules still require physical production and testing.
Las industrias de software escalan cuando el acceso digital se vuelve común. En Brasil, el uso de internet subió del 2,9 % de la población en 2000 al 84,5 % en 2024. La biología no tiene un atajo equivalente porque las moléculas aún requieren producción y pruebas físicas.
Software can become a large export layer without moving physical goods. India’s ICT share stayed near half of service exports across most of the period. China climbed strongly, but remained far below India at 19.1% in 2025.
El software puede convertirse en una gran capa exportadora sin mover bienes físicos. La proporción TIC de India se mantuvo cerca de la mitad de sus exportaciones de servicios durante casi todo el periodo. China subió con fuerza, pero quedó muy por debajo, en 19,1 % en 2025.
Digital specialization can change quickly. Korea began below Japan in 2005 but accelerated after 2013. By 2025, its ICT service export share was 12.5%, more than twice Japan’s 6.0%.
La especialización digital puede cambiar rápidamente. Corea comenzó por debajo de Japón en 2005, pero aceleró después de 2013. En 2025, su proporción de exportaciones de servicios TIC era del 12,5 %, más del doble del 6,0 % de Japón.
Germany and the United Kingdom began close together. Their paths separated after the mid-2010s. Germany finished 2025 at 11.5%, while the United Kingdom ended at 9.0%.
Alemania y el Reino Unido comenzaron cerca. Sus trayectorias se separaron después de mediados de la década de 2010. Alemania terminó 2025 en 11,5 %, mientras el Reino Unido acabó en 9,0 %.
The software share of US service exports climbed gradually for 15 years. It jumped in 2020 and remained near 8% afterward. By 2025, the share was about twice its 2005 level.
La proporción de software en las exportaciones de servicios de Estados Unidos subió gradualmente durante 15 años. Saltó en 2020 y después se mantuvo cerca del 8 %. En 2025 era aproximadamente el doble del nivel de 2005.
Physical digital infrastructure can close a large gap. Korea began 2000 with more than 8 subscriptions per 100 people, while China was near zero. By 2024, China reached 47.2 and Korea 47.8.
La infraestructura digital física puede cerrar una gran brecha. Corea comenzó 2000 con más de 8 suscripciones por cada 100 personas, mientras China estaba cerca de cero. En 2024, China llegó a 47,2 y Corea a 47,8.
Germany and the United Kingdom built broadband at similar speed. Their paths crossed several times before Germany established a modest lead. By 2024, the gap was 3.4 subscriptions per 100 people.
Alemania y el Reino Unido construyeron banda ancha a una velocidad similar. Sus trayectorias se cruzaron varias veces antes de que Alemania estableciera una ventaja modesta. En 2024, la brecha era de 3,4 suscripciones por cada 100 personas.
The United States maintained a broadband lead throughout the period. Brazil still expanded from almost zero to 24.1 subscriptions per 100 people. The remaining gap shows that shared digital infrastructure does not spread evenly.
Estados Unidos mantuvo una ventaja en banda ancha durante todo el periodo. Aun así, Brasil pasó de casi cero a 24,1 suscripciones por cada 100 personas. La brecha restante muestra que la infraestructura digital compartida no se distribuye de manera uniforme.
India’s software export strength did not require broad fixed-broadband penetration. Subscriptions stayed near 1 per 100 people for much of the 2010s. Growth resumed after 2020, but the 2024 level was still only 3.2.
La fortaleza exportadora de software de India no exigió una amplia penetración de banda ancha fija. Las suscripciones se mantuvieron cerca de 1 por cada 100 personas durante gran parte de la década de 2010. El crecimiento se reanudó después de 2020, pero el nivel de 2024 seguía siendo solo 3,2.
The opportunity starts with a combinatorial space of 10.24 trillion ten-residue peptides. The other findings show why that scale does not remove the need for experiments or development.
La oportunidad comienza con un espacio combinatorio de 10,24 billones de péptidos de diez residuos. Los demás hallazgos muestran por qué esa escala no elimina la necesidad de experimentos ni de desarrollo.
Doubling peptide length multiplies the search space by more than 3 million. Four terms make the rest of the argument easier to follow.
Key findings
The AlphaFold database expanded from about 365,000 structures in 2021 to coverage exceeding 214 million protein sequences by 2024. pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
A deep-learning antibiotic study trained on about 2,500 compounds and searched libraries including more than 107 million molecules before identifying halicin. pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
With 20 standard amino acids, sequence space grows from 3.2 million five-residue peptides to 10.24 trillion ten-residue peptides. ponfish.com
On CASP14 protein targets, AlphaFold2 reported median backbone accuracy near 0.96 Å, compared with roughly 2.8 Å for the next-best method.
RFdiffusion produced 19 experimentally confirmed binders among 95 tested designs across five protein targets, a reported hit rate of 20%.
GLP-1 engineering extended half-life from roughly 1 to 2 minutes for native GLP-1 to about 7 days for semaglutide. pmc.ncbi.nlm.nih.gov
At a hypothetical 99% yield per coupling, 50 sequential peptide-synthesis steps leave about 60.5% theoretical full-length product before purification losses.
With fixed assay capacity, increasing candidate generation tenfold reduces the tested share from 100% to 10%, a 90% decline. thecodeforge.io
AMP-Designer produced 18 de novo antimicrobial peptides with broad-spectrum activity against Gram-negative bacteria within 11 days. science.org
The FDA’s 2025 CNPV pilot promises to reduce selected application reviews from 10–12 months to 1–2 months. intuitionlabs.ai
AstraZeneca estimates that 85% of human protein targets are currently considered undruggable by traditional therapeutic approaches. astrazeneca.com
ProteinMPNN reported native sequence recovery near 52%, compared with roughly 33% for Rosetta on its protein-design benchmarks. ipd.uw.edu
The argument
AMP-Designer produced 18 active peptides against Gram-negative bacteria in 11 days.
AlphaFold expanded the searchable protein map from about 365,000 structures to over 214 million sequences.
ProteinMPNN recovered native sequences at 52%, compared with about 33% for Rosetta.
About 2,500 training compounds supported a search across more than 107 million molecules.
PeptiVerse predicts solubility, cellular entry, toxicity avoidance, and persistence before synthesis.
The estimate rises from $2.558 billion before approval to $2.870 billion with later research.
This research is published in English and Spanish. Ver en español
La investigación detrás de esta presentación
Duplicar la longitud del péptido multiplica el espacio de búsqueda por más de 3 millones. Cuatro términos facilitan el seguimiento del resto del argumento.
Hallazgos clave
La base AlphaFold pasó de unas 365.000 estructuras en 2021 a cubrir más de 214 millones de secuencias proteicas en 2024. pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
Un estudio de antibióticos entrenó con unos 2.500 compuestos y buscó en bibliotecas de más de 107 millones antes de identificar la halicina. pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
Con 20 aminoácidos estándar, el espacio crece de 3,2 millones de péptidos de cinco residuos a 10,24 billones de diez residuos. ponfish.com
En las dianas proteicas de CASP14, AlphaFold2 informó una precisión mediana cercana a 0,96 Å, frente a unos 2,8 Å del siguiente método.
RFdiffusion produjo 19 ligandos confirmados entre 95 diseños probados para cinco dianas proteicas, una tasa publicada de 20 %.
La ingeniería de GLP-1 extendió la semivida desde aproximadamente 1 a 2 minutos para GLP-1 nativo hasta unos 7 días para semaglutida. pmc.ncbi.nlm.nih.gov
Con un rendimiento hipotético de 99 % por acoplamiento, 50 pasos dejan cerca de 60,5 % de producto completo antes de pérdidas de purificación.
Con capacidad fija, multiplicar por diez los candidatos reduce la proporción probada de 100 % a 10 %, una caída de 90 %. thecodeforge.io
AMP-Designer produjo en 11 días 18 péptidos antimicrobianos de novo con actividad de amplio espectro contra bacterias gramnegativas. science.org
El programa piloto CNPV de la FDA, anunciado en 2025, promete reducir ciertas revisiones de solicitudes de 10–12 meses a 1–2 meses. intuitionlabs.ai
AstraZeneca estima que el 85 % de las proteínas humanas diana se considera actualmente inaccesible para los enfoques terapéuticos tradicionales. astrazeneca.com
ProteinMPNN informó una recuperación de secuencia nativa cercana a 52 %, frente a aproximadamente 33 % para Rosetta. ipd.uw.edu
El argumento
AMP-Designer produjo 18 péptidos activos contra bacterias gramnegativas en 11 días.
AlphaFold amplió el mapa proteico buscable de unas 365.000 estructuras a más de 214 millones de secuencias.
ProteinMPNN recuperó secuencias nativas en un 52 %, frente a cerca del 33 % de Rosetta.
Unos 2.500 compuestos de entrenamiento permitieron buscar entre más de 107 millones de moléculas.
PeptiVerse predice solubilidad, entrada celular, evasión de toxicidad y persistencia antes de la síntesis.
La estimación sube de 2,558 mil millones antes de la aprobación a 2,870 mil millones con investigación posterior.
Esta investigación se publica en inglés y español. Read in English
